Đại hội diễn ra từ ngày 06/7 đến ngày 07/7/2012. Tại buổi làm việc đầu tiên, Đại hội đã thảo luận, góp ý các nội dung trong văn kiện Đoàn trường và Đoàn cấp trên, thông qua đề án xây dựng Ban Chấp hành Đoàn trường nhiệm kỳ 2012-2014.

Tại phiên làm việc thứ hai, với tinh thần làm việc nghiêm túc, Đại hội đã thảo luận, thống nhất thông qua nội dung văn kiện bao gồm: Báo cáo tổng kết công tác Đoàn và phong trào thanh niên nhiệm kỳ 2009 - 2012; Phương hướng, nhiệm vụ công tác Đoàn và phong trào thanh niên nhiệm kỳ 2012 - 2014 với khẩu hiệu: “Nâng cao chất lượng tổ chức Đoàn, tăng cường bồi dưỡng lý tưởng cách mạng, cổ vũ sinh viên thi đua học tập, nghiên cứu khoa học, xung kích tình nguyện vì tương lai tươi sáng”.

Đại hội đã lắng nghe ý kiến phát biểu chỉ đạo của đồng chí Diệp Thị Minh Phúc - Phó Bí thư Chi bộ, Phó Hiệu trưởng nhà trường và đồng chí Lê Thị Bích Liên - Phó Bí thư tỉnh Đoàn. Các ý kiến đều đánh giá cao những thành tích mà Ban chấp hành và Đoàn viên thanh niên trường đạt được trong thời gian qua, đồng thời cũng nhấn mạnh “trong thời gian tới mỗi đoàn viên, thanh niên cần ra sức vượt mọi khó khăn, thi đua học tập - rèn luyện thật tốt xây dựng Đoàn Thanh niên ngày càng vững mạnh, xứng đáng là lực lượng nòng cốt đi đầu trong phong trào thanh niên”.

Đại hội đã tiến hành bầu cử Ban Chấp hành Đoàn trường gồm 19 đồng chí. Sau đó Ban chấp hành nhiệm kỳ 2012 - 2014 đã tiến hành phiên họp thứ nhất, bầu ra các chức danh chủ chốt. Đồng chí Văn Tấn Thịnh - Bí thư Đoàn trường nhiệm kỳ 2009 - 2012 được tín nhiệm bầu vào chức danh Bí thư nhiệm kỳ 2012 - 2014. Đại hội đã bầu ra đoàn đại biểu dự Đại hội Đoàn tỉnh Bình Thuận gồm 8 đồng chí.

Cũng tại Đại hội, Đoàn trường đã công bố quyết định khen thưởng cho các chi đoàn đạt thành tích cao trong các hoạt động của đoàn nhiệm kỳ 2009 - 2012, tặng quà cho các đồng chí trong BCH nhiệm kỳ 2009 - 2012 không tiếp tục tham vào nhiệm kỳ sau.

Đại hội đã thực sự là ngày hội chính trị quan trọng của tuổi trẻ trường Cao đẳng Y tế Bình Thuận, là dịp để đoàn viên thanh niên nhìn lại những thành quả đã đạt được cũng như nhìn nhận lại những khiếm khuyết trong công tác Đoàn và phong trào thanh niên những năm qua và mở ra một chặng đường mới với kỳ vọng sẽ gắt hái những thành công mới.